中华人民共和国哈尔滨海关（简称哈尔滨海关）是受海关总署直接领导，负责黑龙江省范围内海关工作运行管理、监督监控的正厅级直属海关。主要职责是：负责本关区贯彻落实党中央、国务院关于海关工作的方针政策和决策部署，在履行职责过程中坚持和加强党对海关工作的集中统一领导，履行全面从严治党责任；负责贯彻执行与海关管理相关的法律、法规、规章、规范性文件和相关技术规范，负责本关区征税、监管、缉私、出入境检验检疫、统计等工作；监控研判本关区各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责本关区基层党组织建设、队伍建设和日常管理工作；完成海关总署交办的其他工作。哈尔滨海关现设办公室等15个正处级内设机构，另设机关党委等3个正处级机构。哈尔滨海关政治部承担干部管理、领导基层党组织建设、开展思想政治工作和文化建设、队伍建设等职责。哈尔滨海关党组向隶属海关共派驻10个纪检组。
哈尔滨海关直接领导21个隶属海关单位，其中，副厅级隶属海关1个，正处级隶属海关单位20个。