1949年9月25日新疆和平解放，1950年1月1日新疆省高级人民法院成立，1955年新疆维吾尔自治区成立，新疆省高级人民法院随之改称新疆维吾尔自治区高级人民法院。
新疆高院所辖全区法院158个（地方法院115个、兵团法院43个），其中高级人民法院1个，高级人民法院分院2个（兵团分院、伊犁州分院），中级法院27个（地方14个、兵团13个），基层法院128个（地方99个、兵团29个），设置人民法庭301个。全区法院共有干警10006人（地方法院8894人、兵团法院1112人），其中法官5273人，年均受理案件30万件左右。